يخضع مركز إيداع الأوراق المالية لقانون الأوراق المالية والأنظمة الداخلية والتعليمات الصادرة بموجبه والتي تشمل:

• النظام الداخلي لمركز إيداع الأوراق المالية·
• النظام الداخلي لعوائد مركز إيداع الأوراق المالية·
• النظام الداخلي لصندوق ضمان التسوية·
• النظام الداخلي للعضوية ومعايير السلوك المهني·
• تعليمات تسجيل وإيداع الأوراق المالية وتسويتها.
• تعليمات الإفصاح عن المعلومات والبيانات والسجلات الخاصة بمركز إيداع الأوراق المالية  
•  تعليمات تسجيل وايداع الصكوك وتسويتها 

وتتوفر جميع هذه الأنظمة والتعليمات على الموقع الإلكتروني للمركز.

يتم تقديم الأنظمة الداخلية والتعليمات الخاصة بمركز إيداع الأوراق المالية أو أي تعديلات أو تغييرات تطرأ عليها إلى مجلس مفوضي هيئة الأوراق المالية للموافقة عليها قبل البدء بالعمل بها.ويحق لمجلس مفوضي الهيئة الطلب من مجلس إدارة مركز إيداع الأوراق المالية إجراء التعديلات التي يراها ضرورية على تعليماته أو أنظمته الداخلية والتي يراها ضرورية لحماية المستثمرين وتحقيق المصلحة العامة، وذلك خلال المدة المحددة في طلب التعديل. وعند انتهاء المدة المحددة للتعديل يحق لمجلس مفوضي الهيئة إجراء التعديلات التي يراها مناسبة.

يتم تبليغ أعضاء مركز إيداع الأوراق المالية بهذه التعديلات من خلال تعاميم رسمية يتم إرسالها لهم بالبريد الالكتروني كما ويتم نشرها ضمن الاصدارات على الموقع الإلكتروني للمركز.