أنشئ مركز إيداع الأوراق المالية كمؤسسة ذات نفع عام بموجب قانون الأوراق المالية رقم (23) لسنة 1997، الذي صدر ضمن توجه المملكة الاردنية الهاشمية نحو هيكلة سوق رأس المال بهدف خلق البيئة الاستثمارية الآمنة المستقرة الداعمة للاقتصاد الوطني والجاذبة للاستثمار وفصل الدور الرقابي عن الدور التنفيذي في سوق رأس المال الأردني تنفيذاً للمتطلبات والمعايير الدولية المطبقة في الأسواق المالية حيث أنشأت ثلاث مؤسسات مستقلة هي هيئة الأوراق المالية، وبورصة عمان، ومركز إيداع الأوراق المالية، حيث أن المركز يخضع لرقابة هيئة الأوراق المالية وإشرافها.

بدأ المركز والذي يتمتع بشخصية اعتبارية ذات استقلال مالي وإداري بممارسة مهامه في شهر أيار من عام 1999، ويعتبر المركز الجهة الوحيدة المخولة في المملكة بموجب قانون الأوراق المالية رقم (18) لسنة 2017 بمزاولة المسؤوليات التالية: